This is to acknowledge that

Giuseppe Cotellessa

Attended a one-hour webinar and Q&A session entitled

"Identifying regulatory mechanisms in cancer metastatic processes with an integrated multi-omics approach" / 

Questo per riconoscimento

Giuseppe Cotellessa

Ha partecipato ad un webinar di un'ora ed ad una sessione di domande e risposte dal titolo

"Identificazione dei meccanismi regolatori nei processi metastatici del cancro con un approccio multi-omico integrato" / #7/9/2023

Dott. Giuseppe Cotellessa

Key learning objectives

• Understand how to identify and characterize epigenomic changes using various sequencing approaches (ChIP-seq, ATAC-seq) and mathematic models (pGENMi model)
• Learn how to measure cell migration, invasion, and proliferation with label-free real-time cell analysis technology

Information

Identifying regulatory mechanisms in cancer metastatic processes with an integrated multi-omics approach

Metastatic progression is the primary cause of death in most cancers, yet the regulatory dynamics driving the cellular changes necessary for metastasis remain poorly understood.

In this webinar, Dr. Steven Offer, Mayo Clinic, will discuss how a comprehensive multi-omics approach was used to identify the regulatory mechanisms in cancer metastasis.

By adopting this approach to study colorectal cancer invasiveness in a well-controlled experimental setting, the major regulators of this process were identified. Identifying these latent changes has the potential to greatly improve our understanding of the complex regulatory processes that control metastatic progression. This also helps to identify novel features of cancer that can be therapeutically targeted.

ITALIANO

Obiettivi chiave di apprendimento

Comprendere come identificare e caratterizzare i cambiamenti epigenomici utilizzando vari approcci di sequenziamento (ChIP-seq, ATAC-seq) e modelli matematici (modello pGENMi)

Scopri come misurare la migrazione, l'invasione e la proliferazione cellulare con la tecnologia di analisi cellulare in tempo reale senza etichette

Informazione

Identificazione dei meccanismi regolatori nei processi metastatici del cancro con un approccio multi-omico integrato

La progressione metastatica è la causa principale di morte nella maggior parte dei tumori, tuttavia le dinamiche regolatorie che guidano i cambiamenti cellulari necessari per la metastasi rimangono poco comprese.

In questo webinar, il dottor Steven Offer, della Mayo Clinic, discuterà di come è stato utilizzato un approccio multi-omico completo per identificare i meccanismi regolatori delle metastasi del cancro.

Adottando questo approccio per studiare l'invasività del cancro del colon-retto in un contesto sperimentale ben controllato, sono stati identificati i principali regolatori di questo processo. L’identificazione di questi cambiamenti latenti ha il potenziale per migliorare notevolmente la nostra comprensione dei complessi processi regolatori che controllano la progressione metastatica. Ciò aiuta anche ad identificare nuove caratteristiche del cancro che possono essere mirate terapeuticamente.

Messaggio da medium:#3-9-2023 

Se non visualizza correttamente il messaggio selezioni questo link Per essere sempre certo di ricevere tutte le mie email, segua queste semplici istruzioni     Giuseppe, io non ho alcun dubbio: la cosa più importante al mondo è l'Amicizia! Gli Amici, quelli veri, sono più preziosi di ogni tesoro perché ci capiscono e ci sostengono senza giudicare le nostre azioni. E tu? Hai dei Veri Amici su cui contare? Mi auguro di sì perché lo meriti davvero. Più di chiunque altro io conosca! Se oggi ti scrivo è proprio perché voglio che tu abbia la possibilità di incontrare degli Amici speciali. Delle vere e proprie Anime Affini! Sai di cosa sto parlando? Di quelle persone con cui entri subito in sintonia fin da subito e che sembrano capirti al primo sguardo! Se vuoi scoprire quali sono le tue Anime Amiche ascoltami... io ti porterò da loro! Parola di Diana,

Andamento delle visualizzazioni mensili del blog del Dott. Giuseppe Cotellessa https://genioitalianogiuseppecotellessa.blogspot.com/ / Trend of the monthly views of Dr. Giuseppe Cotellessa's blog https://genioitalianogiuseppecotellessa.blogspot.com/ / #1/9/2023

Dott. Giuseppe Cotellessa

Andamento delle visualizzazioni mensili del blog del Dott. Giuseppe Cotellessa https://genioitalianogiuseppecotellessa.blogspot.com/

ENGLISH

Trend of the monthly views of Dr. Giuseppe Cotellessa's blog https://genioitalianogiuseppecotellessa.blogspot.com/

This is to acknowledge that

Giuseppe Cotellessa

Attended a one-hour webinar and Q&A session entitled

"Unraveling the complexity: Advanced analysis of polymeric nanostructures" / 

Questo per riconoscimento

Giuseppe Cotellessa

Ha partecipato ad un webinar di un'ora ed ad una sessione di domande e risposte dal titolo

"Svelare la complessità: analisi avanzata di nanostrutture polimeriche" / #29/8/2023

Dott. Giuseppe Cotellessa

Key learning objectives

• Learn more about the background and instrumentation for separation and analysis by MD-AF4
• Find out how MD-AF4 determines physical and chemical parameters of natural and synthetic macromolecules
• Discover how MD-AF4 is used to analyze self-assemblies and bioconjugates

Information

Unraveling the complexity: Advanced analysis of polymeric nanostructures

Supramolecular structures formed from bioactive and responsive polymers can be used as smart carrier systems for enzymes or drugs. Given the inherent heterogeneity of these complex nanostructures, their characterization is a significant challenge.

In this exclusive webinar, join experts Dr. Susanne Boye and Dr. Robert Mildner, to learn more about asymmetric-flow field-flow fractionation (AF4), a versatile, state-of-the-art separation technique for simplifying sample matrices, enabling subsequent microstructural analysis. Coupled AF4 with multiple online detectors (multi-angle light scattering, dynamic light scattering, differential refractometer, UV/Vis and differential viscometer) provides rich data for multidimensional characterization and correlation.

The MD-AF4 analytical platform supports in-depth physical and chemical understanding of natural and synthetic macromolecules, their self-assemblies and bioconjugates. Dr. Boye and Dr. Mildner will discuss MD-AF4 and its applications to polymer-protein hybrids, exosome-polymer-hybrids, stimuli-responsive polymeric vesicles and single chain nanoparticles.

ITALIANO

Obiettivi chiave di apprendimento

Scopri di più sul background e sulla strumentazione per la separazione e l'analisi con MD-AF4

Scopri come MD-AF4 determina i parametri fisici e chimici delle macromolecole naturali e sintetiche

Scopri come MD-AF4 viene utilizzato per analizzare autoassemblaggi e bioconiugati

Informazione

Svelare la complessità: analisi avanzata di nanostrutture polimeriche

Le strutture sopramolecolari formate da polimeri bioattivi e reattivi possono essere utilizzate come sistemi di trasporto intelligenti per enzimi o farmaci. Data l’eterogeneità intrinseca di queste complesse nanostrutture, la loro caratterizzazione rappresenta una sfida significativa.

In questo webinar esclusivo, unisciti agli esperti Dr. Susanne Boye e Dr. Robert Mildner, per saperne di più sul frazionamento campo-flusso a flusso asimmetrico (AF4), una tecnica di separazione versatile ed all'avanguardia per semplificare le matrici dei campioni, consentendo la successiva analisi microstrutturale. L'AF4 abbinato a più rilevatori online (scattering della luce multiangolo, scattering della luce dinamico, rifrattometro differenziale, UV/Vis e viscosimetro differenziale) fornisce dati ricchi per la caratterizzazione e la correlazione multidimensionali.

La piattaforma analitica MD-AF4 supporta una comprensione fisica e chimica approfondita delle macromolecole naturali e sintetiche, dei loro autoassemblaggi e dei bioconiugati. Il Dr. Boye e il Dr. Mildner discuteranno di MD-AF4 e delle sue applicazioni agli ibridi polimero-proteina, agli ibridi polimero-esosoma, alle vescicole polimeriche sensibili agli stimoli ed alle nanoparticelle a catena singola.

Attended a one-hour webinar and Q&A session entitled

"Optimizing RNA manufacturing for rapid RNA therapeutics development" / 

Questo per riconoscimento

Giuseppe Cotellessa

Ha partecipato ad un webinar di un'ora ed ad una sessione di domande e risposte intitolata

"Ottimizzazione della produzione di RNA per un rapido sviluppo terapeutico dell'RNA" / #22/8/2023

Dott. Giuseppe Cotellessa

Key learning objectives

• Gain insight into the limitations and bottlenecks faced in the field of RNA therapeutics, specifically related to the stability and functionality of mRNA molecules
• Learn about an optimized IVT manufacturing workflow that addresses the concerns of mRNA manufacturing
• Discover the unique properties of circRNA and how this technology can further enhance stability and longevity compared to linear mRNA

Information

Optimizing RNA manufacturing for rapid RNA therapeutics development

In this webinar, Dr. Fengmei Pi, head of RNA Biology at GenScript’s Innovation Center will discuss key topics related to RNA therapeutics, optimization of mRNA stability and functionality, and the potentials of circular RNA as a novel class of therapeutics. She will also present an optimal in-vitro transcription (IVT) manufacturing workflow for high-performing mRNA production, and address stability and functionality concerns.

Furthermore, Dr. Pi will explore the unique features and advantages of circRNAs as a novel class of therapeutics, and the potential of circRNA to overcome the short half-life limitation of linear mRNA, opening new possibilities for RNA-based therapies.

ITALIANO

Principali obiettivi di apprendimento

• Ottieni informazioni sui limiti e sui colli di bottiglia affrontati nel campo della terapia dell'RNA, in particolare in relazione alla stabilità e alla funzionalità delle molecole di mRNA
• Scopri un flusso di lavoro di produzione IVT ottimizzato che affronta le preoccupazioni della produzione di mRNA
• Scopri le proprietà uniche del circRNA e come questa tecnologia può migliorare ulteriormente la stabilità e la longevità rispetto all'mRNA lineare

Informazione

Ottimizzazione della produzione di RNA per un rapido sviluppo di terapie a base di RNA

In questo webinar, il dottor Fengmei Pi, capo della biologia dell'RNA presso il Centro per l'innovazione di GenScript, discuterà argomenti chiave relativi alle terapie dell'RNA, all'ottimizzazione della stabilità e della funzionalità dell'mRNA e alle potenzialità dell'RNA circolare come nuova classe di terapie. Presenterà inoltre un flusso di lavoro di produzione ottimale della trascrizione in vitro (IVT) per la produzione di mRNA ad alte prestazioni e affronterà i problemi di stabilità e funzionalità.

Inoltre, il Dr. Pi esplorerà le caratteristiche ei vantaggi unici dei circRNA come nuova classe di terapie e il potenziale del circRNA per superare la breve limitazione dell'emivita dell'mRNA lineare, aprendo nuove possibilità per le terapie basate sull'RNA.

 This is to acknowledge that

Giuseppe Cotellessa

Attended a one-hour webinar and Q&A session entitled

"Elucidating cost-effective miniaturized mRNA-seq library construction and implications for the study of circadian rhythms" / 

Questo per riconoscimento

Giuseppe Cotellessa

Ha partecipato ad un webinar di un'ora ed ad una sessione di domande e risposte intitolata

"Chiarire la costruzione della libreria mRNA-seq miniaturizzata conveniente e le implicazioni per lo studio dei ritmi circadiani" /#15/8/2023

Dott. Giuseppe Cotellessa 

Key learning objectives

• Explore the first-hand experience of automation-enabled miniaturization of mRNA-seq
• Learn about the first-hand experience of the utility of mosquito and dragonfly discovery for NGS in a shared core facility
• Understand the fundamental mechanism of molecular clocks and their impact on physiology, using skeletal muscle as a tissue focus
• Discover the application of sequencing tools to investigate the influence of circadian rhythms, particularly with aging

Information

Elucidating cost-effective miniaturized mRNA-seq library construction and implications for the study of circadian rhythms

Dr. Esser’s group at the University of Florida previously showed that cellular circadian clocks direct a daily transcriptional program that supports homeostasis and resilience. To further learn the age-associated changes in circadian functions, they profiled the circadian transcriptome in different tissues including skeletal muscle, the heart, and others. This study has more than 440 samples.

To speed up the library construction and potentially save reagents cost, we manually tested ½x, ¼x, 1/5x and 1/10x reduced reaction volumes for RNA-seq library construction using NEB Ultra Directional RNA-seq kit. The results showed that 1/5x gave us reliable results. Thus, by leveraging the mosquito® and dragonfly® discovery automated liquid handling systems for mRNA-seq library construction with 1/5x reduced reaction, reagent costs were reduced five-fold via miniaturization whilst maximizing the reliability of an automated workflow.

ITALIANO

Principali obiettivi di apprendimento

Esplora l'esperienza di prima mano della miniaturizzazione abilitata all'automazione di mRNA-seq

Scopri l'esperienza diretta dell'utilità della scoperta di zanzare e libellule per NGS in una struttura centrale condivisa

Comprendere il meccanismo fondamentale degli orologi molecolari ed il loro impatto sulla fisiologia, utilizzando il muscolo scheletrico come focus tissutale

Scopri l'applicazione degli strumenti di sequenziamento per studiare l'influenza dei ritmi circadiani, in particolare con l'invecchiamento

Informazione

Chiarire la costruzione della libreria mRNA-seq miniaturizzata conveniente e le implicazioni per lo studio dei ritmi circadiani

Il gruppo del Dr. Esser presso l'Università della Florida ha precedentemente dimostrato che gli orologi circadiani cellulari dirigono un programma trascrizionale quotidiano che supporta l'omeostasi e la resilienza. Per apprendere ulteriormente i cambiamenti associati all'età nelle funzioni circadiane, hanno profilato il trascrittoma circadiano in diversi tessuti tra cui il muscolo scheletrico, il cuore ed altri. Questo studio ha più di 440 campioni.

Per accelerare la costruzione della libreria e potenzialmente risparmiare sui costi dei reagenti, abbiamo testato manualmente volumi di reazione ridotti di ½x, ¼x, 1/5x e 1/10x per la costruzione della libreria RNA-seq utilizzando il kit NEB Ultra Directional RNA-seq. I risultati hanno mostrato che 1/5x ci ha dato risultati affidabili. Pertanto, sfruttando i sistemi automatizzati di gestione dei liquidi per la scoperta di mosquito® e dragonfly® per la costruzione di librerie mRNA-seq con una reazione ridotta di 1/5 volte, i costi dei reagenti sono stati ridotti di cinque volte tramite la miniaturizzazione, massimizzando al contempo l'affidabilità di un flusso di lavoro automatizzato.

Messaggio da Medium: #9/8/2023

Congratulazioni al Dott. Giuseppe Cotellessa da Istituto Italiano di Cultura di Napoli per le Sue poesie meritevoli di essere pubblicate insieme ad altri testi di rilevanti poeti italiani contemporanei / Congratulations to Dr. Giuseppe Cotellessa from the Italian Cultural Institute of Naples for your poems worthy of being published together with other texts by relevant contemporary Italian poets /#4/8/2023

Dott. Giuseppe Cotellessa

Il Comitato editoriale, dopo un lungo ed attento vaglio del vastissimo materiale inedito pervenuto in Redazione (alcune migliaia di poesie di circa quattrocento autori), ha ritenuto le Sue poesie meritevoli di essere pubblicate nell’antologia insieme ad altri testi di rilevanti poeti italiani contemporanei.

ENGLISH

The Editorial Committee, after a long and careful examination of the vast unpublished material received by the editorial staff (several thousand poems by about four hundred authors), deemed your poems worthy of being published in the anthology together with other texts by relevant contemporary Italian poets.

This is to acknowledge that

Giuseppe Cotellessa

Attended a one-hour webinar and Q&A session entitled

"Mapping the epigenome of the neural progenitors in the embryonic mouse forebrain using cell sorting and single cell transcriptomics to characterize interneuron diversity" / 

Questo per riconoscimento

Giuseppe Cotellessa

Ha partecipato ad un webinar di un'ora ed ad una sessione di domande e risposte intitolata

"Mappatura dell'epigenoma dei progenitori neurali nel cervello anteriore del topo embrionale utilizzando lo smistamento delle cellule e la trascrittomica a singola cellula per caratterizzare la diversità degli interneuroni" /#31/7/2023

Dott. Giuseppe Cotellessa 

Key learning objectives

• Understand how to characterize changes in chromatin accessibility at enhancers and promoters that are tightly coupled to transcript abundance during neurodevelopment
• Learn how a single-cell assay for transposase-accessible chromatin with sequencing (scATAC-Seq), in combination with Cut&Tag and Hi-C/Capture-C, can be used to generate an ‘Epigenome Atlas’ of the embryonic mouse brain
• Identify strategies for rapid isolation of single cells or nuclei from embryonic mouse brain with microfluidics-based cell sorting for use in transcriptional profiling of the brain progenitor cells

Information

Mapping the epigenome of the neural progenitors in the embryonic mouse forebrain using cell sorting and single cell transcriptomics to characterize interneuron diversity

The epigenetic landscape is continually changing during cell proliferation and differentiation throughout development. A common theme emerging from genome-wide association studies (GWAS) is that polymorphisms linked to various diseases are enriched in non-coding regions in the genomes, such as enhancers. Many genes associated with neurological and psychiatric diseases are expressed during embryonic development, and particularly in GABAergic inhibitory interneurons. A comprehensive characterization of epigenomic organization in the embryonic mouse forebrain will enhance our understanding of normal development and provide insight into mechanisms of neurological disease.

In this webinar, Dr Timothy Petros from the NIH, will discuss his research on how intrinsic genetic programs and environmental signals interact to generate interneuron diversity. His group uses the SH800 Cell Sorter to enrich cells and nuclei suspensions from brain dissections. The Petros Lab has performed single-cell chromatin accessibility (snATAC-seq) and transcriptome (scRNA-seq) profiles from four regions of the embryonic mouse forebrain (MGE, LGE, CGE, and cortex) that give rise to distinct neuronal subtypes.

Using this approach, they identified thousands of differentially accessible peaks, many restricted to distinct progenitor cell types and/or brain regions. This dataset defines a ‘ground truth’ epigenomic landscape and reveals a diverse chromatin landscape. The data can be used to explore how perturbation of gene regulation in GABAergic inhibitory interneuron progenitors affects gene expression, chromatin organization, and, ultimately, cell fate.

ITALIANO

Principali obiettivi di apprendimento

Comprendere come caratterizzare i cambiamenti nell'accessibilità della cromatina a potenziatori e promotori che sono strettamente accoppiati all'abbondanza di trascrizione durante il neurosviluppo

Scopri come un test a singola cellula per la cromatina accessibile alla trasposasi con sequenziamento (scATAC-Seq), in combinazione con Cut&Tag e Hi-C/Capture-C, può essere utilizzato per generare un "Epigenome Atlas" del cervello embrionale del topo

Identificare le strategie per il rapido isolamento di singole cellule o nuclei dal cervello di topo embrionale con l'ordinamento delle cellule basato sulla microfluidica per l'uso nella profilazione trascrizionale delle cellule progenitrici del cervello

Informazione

Mappatura dell'epigenoma dei progenitori neurali nel cervello anteriore del topo embrionale utilizzando lo smistamento delle cellule e la trascrittomica a singola cellula per caratterizzare la diversità degli interneuroni

Il panorama epigenetico cambia continuamente durante la proliferazione cellulare e la differenziazione durante lo sviluppo. Un tema comune che emerge dagli studi di associazione su tutto il genoma (GWAS) è che i polimorfismi legati a varie malattie sono arricchiti in regioni non codificanti nei genomi, come gli esaltatori. Molti geni associati a malattie neurologiche e psichiatriche sono espressi durante lo sviluppo embrionale, ed in particolare negli interneuroni GABAergici inibitori. Una caratterizzazione completa dell'organizzazione epigenomica nel cervello anteriore del topo embrionale migliorerà la nostra comprensione del normale sviluppo e fornirà informazioni sui meccanismi della malattia neurologica.

In questo webinar, il dottor Timothy Petros del NIH, discuterà della sua ricerca su come i programmi genetici intrinseci ed i segnali ambientali interagiscono per generare la diversità degli interneuroni. Il suo gruppo utilizza lo SH800 Cell Sorter per arricchire cellule e sospensioni di nuclei da dissezioni cerebrali. Il Petros Lab ha eseguito profili di accessibilità della cromatina a singola cellula (snATAC-seq) e trascrittoma (scRNA-seq) da quattro regioni del cervello anteriore del topo embrionale (MGE, LGE, CGE e corteccia) che danno origine a distinti sottotipi neuronali.

Usando questo approccio, hanno identificato migliaia di picchi accessibili in modo differenziato, molti limitati a distinti tipi di cellule progenitrici e/o regioni cerebrali. Questo set di dati definisce un panorama epigenomico di "verità fondamentale" e rivela un diverso panorama della cromatina. I dati possono essere utilizzati per esplorare come la perturbazione della regolazione genica nei progenitori degli interneuroni inibitori GABAergici influenzi l'espressione genica, l'organizzazione della cromatina e, in definitiva, il destino cellulare.