This is to acknowledge that
Giuseppe Cotellessa
Attended a one-hour webinar and Q&A session entitled
Exploring topics in NGS workflows: The importance of sample QC for downstream sequencing data, scaling sample throughput and automation /
Questo per riconoscimento
Giuseppe Cotellessa
Ha partecipato ad un webinar di un'ora ed ad una sessione di domande e risposte intitolata
"Esplorazione degli argomenti nei flussi di lavoro NGS: l'importanza del controllo qualità del campione per i dati di sequenziamento a valle, il ridimensionamento della velocità effettiva del campione e l'automazione" / #6-5-2022
Dott. Giuseppe Cotellessa
Key Learning Outcomes
The connection between key NGS QC metrics and downstream sequencing results
Methods to secure optimal NGS results by applying sample QC
Advantages of the TapeStation automated electrophoresis systemsKerry
Information
Achieve successful sequencing data based on input sample and library quality control
Next-generation sequencing (NGS) has transformed the way genomes are analyzed. As technologies trend towards higher throughput, lower cost, and improved data quality, standardization and quality control remain key topics in the NGS workflow.
In this SelectScience NGS webinar series, produced in partnership with Agilent Technologies, we explore the importance of input sample quality control (QC). The webinar demonstrates how sample QC relates to the quality of downstream sequencing results and examines key QC aspects to consider when scaling NGS throughput and automation. This series features presentations from expert speakers with a variety of scientific backgrounds and consists of two webinars.
Achieve successful sequencing data based on input sample and library quality control
This webinar will demonstrate how rigorous quality control (QC) of samples and libraries is crucial to producing high-quality data in next-generation sequencing (NGS). Sample QC metrics like concentration, DNA and RNA integrity numbers, 28S/18S ratio, DV200, fragment length, and amount of adapter dimers will be covered. How these metrics provide reasonable estimates for downstream NGS sequencing parameters such as on-target rate, duplication rate, and sequencing coverage will be discussed.
Carsten Maus, Ph.D., is a bioinformatician at the NGS Core Facility of the German Cancer Research Center (DKFZ) in Heidelberg. Dr. Maus shares his experience on the dependencies between the quality of samples, libraries, and data within a high-throughput sequencing unit.
Rainer Nitsche, Ph.D., Product Manager, Agilent Technologies, will give a brief overview of the Agilent TapeStation systems and how they can be used to collect QC metrics from RNA and DNA samples.
ITALIANO
Principali risultati di apprendimento
La connessione tra le metriche chiave del QC NGS ed i risultati del sequenziamento a valle
Metodi per garantire risultati NGS ottimali applicando il controllo qualità del campione
Vantaggi dei sistemi di elettroforesi automatizzata TapeStation
Informazione
Ottieni dati di sequenziamento di successo basati su campioni di input e controllo di qualità della libreria
Il sequenziamento di nuova generazione (NGS) ha trasformato il modo in cui vengono analizzati i genomi. Poiché le tecnologie tendono verso una maggiore produttività, costi inferiori ed una migliore qualità dei dati, la standardizzazione e il controllo della qualità rimangono argomenti chiave nel flusso di lavoro di NGS.
In questa serie di webinar SelectScience NGS, prodotta in collaborazione con Agilent Technologies, esploriamo l'importanza del controllo della qualità del campione di input (QC). Il webinar dimostra in che modo il QC del campione è correlato alla qualità dei risultati del sequenziamento a valle ed esamina gli aspetti chiave del QC da considerare quando si ridimensiona il throughput e l'automazione di NGS. Questa serie presenta presentazioni di relatori esperti con una varietà di background scientifici.
Ottieni dati di sequenziamento di successo basati su campioni di input e controllo di qualità della libreria
Questo webinar dimostrerà come il rigoroso controllo di qualità (QC) di campioni e librerie sia fondamentale per produrre dati di alta qualità nel sequenziamento di prossima generazione (NGS). Saranno trattate le metriche QC del campione come concentrazione, numeri di integrità del DNA e RNA, rapporto 28S/18S, DV200, lunghezza del frammento e quantità di dimeri dell'adattatore. Verrà discusso il modo in cui queste metriche forniscono stime ragionevoli per i parametri di sequenziamento NGS a valle come il tasso di destinazione, il tasso di duplicazione e la copertura del sequenziamento.
Carsten Maus, Ph.D., è un bioinformatico presso la NGS Core Facility del German Cancer Research Center (DKFZ) a Heidelberg. Il Dr. Maus condivide la sua esperienza sulle dipendenze tra la qualità di campioni, librerie e dati all'interno di un'unità di sequenziamento ad alto rendimento.
Rainer Nitsche, Ph.D., Product Manager, Agilent Technologies, fornirà una breve panoramica dei sistemi Agilent TapeStation e di come possono essere utilizzati per raccogliere le metriche QC da campioni di RNA e DNA.
